Việc lựa chọn nguyên liệu làm phân hữu cơ và phân hữu cơ sinh học có thể là các loại phân chuồng và chất thải hữu cơ.Công thức sản xuất cơ bản thay đổi tùy theo chủng loại và nguyên liệu thô;Nguyên liệu cơ bản là: phân gà, phân vịt, phân ngỗng, phân lợn, phân gia súc và cừu, rơm rạ, bùn lọc công nghiệp đường, bã mía, bã củ cải đường, hạt chưng cất, cặn thuốc, cặn furfural, cặn nấm, đậu bánh, bánh hạt bông, bánh hạt cải, than cỏ, v.v.